邓迪大学科学家通过创新的分子“切割和缝合”工艺设计出一种研究工具,可以加速针对癌症等没有其他治疗选择的疾病的药物设计。
该大学靶向蛋白质降解中心的专家定制了一种蛋白质的新版本,这种蛋白质通常被称为“蛋白质降解剂”。该过程在将剩余部分缝合在一起之前去除蛋白质中不需要的部分,使研究人员能够分离蛋白质并在实验室中更有效地对其进行研究。
这项开创性的研究已发表在《自然通讯》杂志上。
蛋白质降解剂预示着药物研发领域的一场革命,目前有 50 多种此类药物正在临床试验中测试。这类分子的作用方式与传统药物有根本区别。降解剂药物不仅仅阻断致病蛋白质,还会招募或劫持这些蛋白质,使它们粘附在一种名为泛素 E3 连接酶的重要蛋白质上,该蛋白质是细胞蛋白质回收机制的一部分。这种招募是药物发挥作用的基础,可导致致病蛋白质被破坏并从细胞内彻底清除。
目前,患者服用的大多数药物都以这种方式发挥作用,劫持了一种名为 Cereblon (CRBN) 的 E3 连接酶。到目前为止,设计更安全、更像药物的分子并了解它们如何将致病蛋白质招募到 CRBN 的方法一直很缓慢且效率低下。然而,由结构生物学家Alena Kroupova 博士和David Zollman 博士领导的邓迪团队在Alessio Ciulli 教授的小组中,设计出了一种巧妙的方法来设计这种蛋白质的新变体,他们称之为“CRBN-midi”。
这包括去除蛋白质中不需要的部分,并将剩余部分缝合在一起。这提高了分离蛋白质并在实验室中对其进行研究的能力。
该研究的第一作者 Kroupova 博士说:“我们的 CRBN 蛋白变体比母体蛋白更易溶解、更容易结晶,同时行为方式与其接近并保留了其生物学特性。
“这使得它非常适合当今广泛用于靶向蛋白质降解领域的许多实验和过程。
该研究的共同通讯作者 Zollman 博士补充道:“TPD 彻底改变了药物设计领域,这一突破将进一步帮助加速生成通过这种蛋白质起作用的新型降解药物,最终将使生活在我们这个时代最紧迫的健康挑战中的患者受益。”
“我们已通过Addgene 门户网站向科学界广泛提供我们的 CRBN-midi 试剂,没有任何限制和附加条件。自 2024 年 1 月我们首次以预印本形式披露以来,它已经非常受欢迎,”Ciulli 教授说。“包括学术界和生物制药行业在内的全球许多研究团体已经将其用于他们的研究和药物发现计划。”
这个领域非常令人兴奋,Ivan Dikic 教授(德国法兰克福歌德大学)的实验室还开发了一项披露相关分子工具设计的补充研究 - 凸显了该领域的快速进展。